鲤城区疾病预防控制中心于2005年1月在原鲤城区卫生防疫站基础组建，隶属区卫健局管理副科级事业单位，承担全区的疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测检验与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导等工作，是全区疾病预防控制工作的业务指导机构，同时也是全区大中专毕业生就业见习基地。

　　中心现有办公场所5000余平，其中实验室面积1600平；内设办公室、健教股、应传股、慢病股、卫生监测综合股、检验股等6个股室。核编58人，现在编44人(男14人，女30人)；其中，专业技术人员33人（高级职称7人，中级13人，初级18人），中心支部中共党员18人。建有“自动细菌鉴定/药敏分析专业实验室”、“100级净化室”、“AIDS初筛实验室”、“新型冠状病毒核酸检测实验室”等专业实验室，配备美国安捷伦气相色谱仪、北京瑞利原子吸收分光光度计、原子荧光光度计、美国BD自动细菌鉴定/药敏分析系统、连续流动分析仪、荧光定量PCR仪等大型仪器设备，具备开展项目102项。

　　历年来，获得了“福建省“十二五”地方病防治工作先进集体”、“福建省免疫规划工作先进集体”、“福建省传染病疫情及突发公共卫生事件报告管理先进集体”、“全省健康教育与健康促进工作先进集体”、“鲤城区文明单位”、“鲤城区‘工人先锋号’先进集体”等荣誉称号。